基本治療後の再評価検査においてプラークコントロール（口腔衛生状態）が改善しているにもかかわらず、歯肉の炎症（ポケット測定時の出血）が持続していて、深い歯周ポケットが存在することがあります。こうした場合には、ポケット内の歯根面に歯石の取り残しがあることがあります。
Fleischer ら（ 1989 ）によると、複根歯（歯根が 2 本以上ある歯）のSRP（深いポケット内の歯石除去）後、 4 － 6 ｍｍの歯周ポケットで除去できる歯石は、10 年以上の経験のある歯周病専門医で 27 ％、一般開業医では 8 ％にすぎません。
つまり深い歯周ポケットでは、歯石除去後も大半の歯石が残っています。歯肉を切開し、歯根面の歯石を確実に目で見て確認し、これを除去するための手術が歯周外科です。
（上の写真では、歯根面のくぼみに取り残された歯石を歯周外科時に除去しています。）
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